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标题：A DNA extraction protocol and initial primers screenining in hieronima alchorneoides Fr. All. for aflp applications
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作者：Emanuel Araya ; Olman Murillo ; Gabriel Aguilar 等
期刊名称：Foresta Veracruzana
印刷版ISSN：1405-7247
出版年度：2005
卷号：7
期号：1
页码：1-4
语种：Spanish
出版社：Recursos Genéticos Forestales
摘要：Un método de extracción de ADN simple, rápido y de alto rendimiento fue desarrollado para Hyeronima alchorneoides. Este método está basado en el uso de CTAB y es una modificación de un protocolo reportado previamente. Para determinar la calidad del ADN extraído se utilizaron tres métodos: electroforesis en un gel de agarosa al 0.8%, digestión del ADN con las enzimas de restricción EcoR I y Hind III y cuantificación del ADN en un fluorómetro. Con el procedimiento desarrollado se obtuvo ADN de alta calidad, con valores entre los 30 y 40 ng/µL. Además, con el método descrito en este estudio, el ADN extraído fue completamente digerido con EcoR I y Hind III. Se realizaron reacciones de AFLP para evaluar la idoneidad del ADN extraído. Cincuenta y seis combinaciones de imprimadores selectivos de AFLP fueron evaluados para la amplificación del ADN, pero solamente nueve combinaciones de imprimadores selectivos amplificaron para el ADN extraído de Hyeronima alchorneoides. Veinticinco combinaciones de imprimadores mostraron una un alto número de bandas y una alta resolución de las mismas
其他摘要：A simple, fast and high yielding DNA extraction method for Hyeronima alchorneoides was developed. This method is based on a modified CTAB protocol. Three methods were used for DNA quality determination: an agarose gel (0.8%) electrophoresis, DNA digestion with restriction enzymes EcoR I and Hind III, and quantification in a fluorometer. The procedure showed to yield good quality DNA, with values between 30-40 ng/µL. With the method described in this study, DNA extracted was completely digested with EcoR I and Hind III. AFLP reactions were performed in order to evaluate the suitability of the extracted DNA. Fifty six primer combinations were evaluated for amplifying DNA, but only forty nine combinations amplified for the extracted DNA from Hyeronima alchorneoides. Twenty five primer combinations showed a high resolution banding and a large number of bands
关键词：AFLP; CTAB; DNA extraction; Hyeronima alchorneoides; primer combinations