Ephemeraceae possui dois gêneros e 37 espécies no mundo, para o Neotrópico são registradas 13 espécies, sendo 10 citadas para o Brasil. As plantas são pequenas e as maiores possuem menos de 3 mm de altura, e sempre são encontradas em pequenos tufos sendo, dessa maneira um grupo pouco coletado e por causa da ausência de tratamentos taxonômicos este grupo é muito pouco conhecido no Brasil. Este estudo foi baseado em 11 materiais tipo (de todas as espécies endêmicas do Brasil), re-análise dos espécimes citados em literatura e espécimes depositados em herbário. Foram reconhecidas 10 espécies para o Brasil, Ephemerum homomallum Müll.Hal. é um novo registro para o Brasil, Micromitrium subaequinoctiale (Broth.) Crosby foi sinonimizado com M. lacustre (Müll.Hal.) Crosby e a ocorrência de M. wrightii (Müll.Hal.) Crosby foi excluída do Brasil. São apresentadas chaves, e comentários e ilustrações diagnósticas.