清酒酵母を識別するために,長鎖末端反復配列(LTR)の領域100ヶ所を対象にPCR反応を試みた。その結果, YDRWdelta 25, YELWdelta 5, YLRWdelta 20, YGRWdelta 21,及び YPLWdelta 7のLTR領域由来の5組のプライマーにより増幅DNA断片に差が認められた。増幅DNA断片はその鎖長ではなく,有無で差異が認められた。清酒酵母の増幅DNA断片からK-6及びNo28が特定され,他の株は3グループに分けられた。